Ainda em criança, Christoph Hauser descobriu o seu interesse pela música, especialmente pelo canto e pelos instrumentos de tecla. Aos nove anos, recebeu a sua primeira aula com o organista da Basílica de Ottobeuren. Depois de terminar os seus estudos regulares, estudou piano e órgão na Universidade de Música e Teatro de Munique, passando no exame com distinção. Teve, também, masterclasses com muitos artistas importantes, incluindo Ben van Oosten, Ton Koopman, Guy Bovet e Pierre Pincemaille. Leccionou na Universidade de Música de Munique e na Academia de Música da Escola para Cegos da Baviera e actuou em transmissões de rádio e televisão. Em 2014, Hauser foi nomeado organista do famoso órgão barroco no Fuerstenfeld Minster em Fuerstenfeldbruck, construído por Johann Georg Fux em 1736 (com muitos tubos e partes do instrumento precedente de 1629) e é aí responsável por uma reputada série de concertos. Além disso, é director de vários coros, como o Vokalensemble 1600 München, especialistas na música da Renascença. Hauser apresenta-se regularmente na Alemanha e noutros países e realizou várias gravações discográficas. Hauser apresenta-se regularmente na Alemanha e noutros países, participando em séries de concertos e festivais de renome. As suas gravações em CD são muito aclamadas. A primeira gravação do órgão Fux, Per vibrationem aeris, foi lançada em 2020.